2004年
四川沱江特大水污染事故
2004年2月底和3月初，四川化工股份有限公司第二化肥廠將大量高濃度氨氮廢水排入沱江支流毗河，導致沱江江水變黃變臭，氨氮超標竟達50倍。50萬公斤網箱魚死亡，直接經濟損失3億元左右。沿江簡陽、資中、內江三地被迫停水4周。
2004年5月初，四川省眉山市仁壽縣東方紅紙業公司頂風作案，違規偷排、超標排放造紙黑液，致使沱江再次遭到嚴重污染，造成死魚12萬斤。隨后，眉山市對企業實施了停電、停產、停排處理，切割了全部生產蒸球，徹底切斷了污染源。
2006年
湖南岳陽砷污染事件
2006年9月8日，湖南省岳陽縣城飲用水源地新墻河發生水污染事件，砷超標10倍左右，8萬居民的飲用水安全受到威脅。
經調查，造成此次污染的禍首是上游3家化工廠排放工業污水，致使大量高濃度含砷廢水流入新墻河。
事件發生后，國務院領導高度重視，湖南省政府報告及時，就污染防控工作進行了具體部署。原國家環保總局迅速派出工作組趕赴現場協助地方政府實施污染防控。
吉林牤牛河水污染事件
2006年8月21日，吉林省蛟河市吉林長白精細化工有限公司約10噸工業廢液傾入吉林市牤牛河，主要污染物為N、N-二甲基苯胺、4-氨基-N、N-二甲基苯胺，引發了嚴重的水環境污染事件。
此次污染事件引起黨中央、國務院領導高度重視，在原國家環保總局的協調、指導下，吉林省和吉林市政府及時采取有效措施妥善處置，將污染控制、消除在松花江支流牤牛河內，未對松花江造成污染。
事故發生后，吉林市政府立即責令長白精細化工有限公司停產，吉林市公安部門立即將企業法人、肇事司機等有關責任人刑事拘留，由司法機關依法處理。最終，肇事司機等兩名直接責任人均因造成重大環境污染事故被處以3年有期徒刑。
2007年
太湖、巢湖、滇池暴發藍藻危機
從2007年5月29日開始，江蘇省無錫市城區的大批市民家中自來水水質突然發生變化，并伴有難聞的氣味，無法正常飲用。連續高溫高熱，導致太湖藍藻在短期內急劇暴發，令水源水質迅速惡化。進入6月，巢湖、滇池也出現藍藻。
江蘇沭陽水污染事件
2007年7月2日下午3時，江蘇沭陽縣地面水廠發現，短時間內，大流量的污水侵入位于淮沭河的自來水廠取水口。經檢測，取水口的水氨氮含量為每升28毫克左右，遠遠超出國家取水口水質標準。20萬人口用水受到影響。
來自于宿遷市上游境外的客水污染團7月1日進入新沂河沭陽段，最大流量達到350立方米/秒，超過平時6倍，氨氮濃度超標34倍。
同年7月3日，針對中國當前嚴峻的水污染形勢，原國家環保總局開始對長江、黃河、淮河、海河四大流域水污染嚴重、環境違法問題突出的6市2縣5個工業園區實行“流域限批”——對部分同處一個流域內污染嚴重的縣市或工業園區同時“限批”；對流域內32家重污染企業及6家污水處理廠實行掛牌督辦。
2008年
云南陽宗海砷污染事件
2008年6月以來，云南九大高原湖泊之一的陽宗海被測出水體中的砷濃度嚴重超出飲用水安全標準，直接危及兩萬人的飲水安全。從7月8日起，沿湖周邊民眾及企業全面停止從中取水作為生活飲用水。
同年9月12日，云南省政府決定對陽宗海實施“三禁”，即禁止飲用、禁止游泳、禁止捕撈水生產品。云南省決定采取措施查處污染企業，啟動綜合治污措施，爭取用3年左右使陽宗海水質恢復正常。
因這起污染事件，云南省對26名政府工作人員實施了行政問責，其中對12人予以免職處分。為強化環境執法，昆明市公安局成立了環境保護分局，這一機構設置在全國尚屬首次。
2009年
江蘇鹽城水污染事件
2009年2月20日，因自來水水源受到酚類化合物污染，江蘇省鹽城市大面積斷水近67小時，20萬市民生活受到影響，占鹽城市市區人口的2/5。據調查，鹽城市標新化工廠為減少治污成本，居然趁大雨天偷排了30噸化工廢水，最終污染了水源地。
事后，這家廠兩名負責人因“投放危險物質罪”分別被判處10年和6年有期徒刑，這也是我國首次以這一罪名對環境污染事件作出刑事處罰。
山東沂南砷污染事件
2009年4月，山東沂南縣億鑫化工有限公司在未獲批相關手續的情況下，非法生產阿散酸，并將生產過程中產生的大量含砷有毒廢水存放在一處蓄意隱藏的污水池中。7月20日、23日深夜，趁當地降雨，這家公司用水泵將含砷量超標2.7254萬倍的廢水排放到南涑河中，造成水體嚴重污染。事后，3名涉案負責人被分別判刑，并被判共同賠償國家3714萬元的經濟損失。
陜西漢陰尾礦庫塌陷事故
2009年8月29日、30日，陜西漢陰縣黃龍金礦尾礦庫排洪涵洞尾部相繼發生兩處塌陷，約8000立方米左右尾砂泄漏。險情導致尾礦庫附近的青泥河水受到嚴重污染，并嚴重威脅漢陰縣水源地觀音河水庫水質。
2010年
紫金礦業銅酸水滲漏事故
2010年7月3日，福建省紫金礦業集團有限公司紫金山銅礦濕法廠發生銅酸水滲漏，9100立方米的污水順著排洪涵洞流入汀江。但紫金礦業卻將這起污染事故隱瞞9天才進行公告，并因應急處置不力，導致7月16日再次發生污水滲透。
2010年9月21日，信宜紫金礦業有限公司銀巖錫礦高旗嶺尾礦庫發生潰壩事件，造成重大人員傷亡和財產損失。
事發后，當地多名官員被停職檢查或責令辭職，相關企業負責人被刑事拘留。2010年10月8日，福建省環保局對紫金礦業作出罰款956.313萬元的行政處罰決定。
松花江化工桶事件
2010年7月28日，吉林省兩家化工企業的倉庫被洪水沖毀，7138只物料桶被沖入溫德河，隨后進入松花江，污染帶長5公里。為防止危機擴大，沿岸出動上萬人攔截，城市供水管道被切斷。
2011年
云南曲靖鉻渣污染事件
2011年8月，云南曲靖陸良化工實業有限公司將5222.38噸重毒化工廢料鉻渣非法傾倒，導致珠江源頭南盤江水質受到嚴重污染，農村77頭牲畜死亡，并對周圍農村及山區留下長期的生態風險。
2014年
江蘇靖江水污染事件
2014年5月9日上午，江蘇省靖江市因飲用水水源地水質異常停止供水，全市近70萬人的生產、生活因此受影響，并引發了搶水潮。事件發生后，當地政府因及時應對：第一時間啟用備用水源，5月11日上午恢復正常供水。
據介紹，已經基本可以認定造成靖江水污染的原因是犯罪式排放、傾倒危廢行為。案件已移交警方調查。
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